biologia molekularna krótkie wykłady sekcja D

 0    127 fiche    aleksanderwieckowski
ladda ner mp3 skriva ut spela Kontrollera dig själv
 
Fråga język polski Svar język polski
escherichia coli jaki ma genom
börja lära sig
genom prokariotyczny
jak wygląda DNA E. coli
börja lära sig
pojedyncza koliście zamknięta cząsteczka DNA
jaka długość ma DNA E. coli
börja lära sig
4.6 miliona par zasad
W co jest upakowane DNA E. coli
börja lära sig
w nukleoid
jakie stężenie ma nukleoid E. coli
börja lära sig
(duże) 30-50 mg*ml-1
z ilu domen składa się nukleoid E. coli
börja lära sig
50-100 domen
kształt nukleidu e. coli
börja lära sig
domeny przytwierdzone do białka przytwierdzonego do błony komórkowej widok gwiazdy
Chromosom E. coli całościowo jest jaki?
börja lära sig
Superhelikalny ∆Lk? Ln(n) =0.06
Co niepozwala rotować się DNA E. coli
börja lära sig
Przyłaczenie DNA do białkowo-błonowego rusztowania
Najczęstsze białka wiążące DNA?
börja lära sig
HU i H-NS
Białko HU jest?
börja lära sig
-małe; zasadowe; z ładunkiem dodatnim; w postaci dimeru
jak białko HU wiąże DNA?
börja lära sig
Wiąże owijając wokół własnej cząsteczki
Inna nazwa białka H-NS
börja lära sig
wcześniejsza nazwa białko H1
Białko H-NS jest?
börja lära sig
monomerem; ma obojętny ładunek;
Białko H-NS preferuje wiązanie się z DNA jakim?
börja lära sig
Niespecyficznym przede wszystkim miejsca zagięć helisy DNA
Angielska nazwa H-NS oraz HU (zwyczajowa)
börja lära sig
Białko podobne do histonów - Histone-like proteins
na co ma wpływ białka H-NS oraz HU
börja lära sig
na kondensacje DNA
Do czego jest potrzebna kondensacja DNA
börja lära sig
Jest niezbędna by upakować DNA w nukleotyd i utrzymaniu struktury superhelikalnej chromosomu
co znaczy ∆Lk/Lk(-3)
börja lära sig
ze mamy jeden skręt superhelikalny na każde 17 skrętów helisy, w tym połowa skrętów jest wymuszona przez trwałe owiniecie wokół białek HU
inne ważne czynniki w organizowaniu domen DNA
börja lära sig
białka, RNA, mRNA, polimeraza RNA
homolog białka HU?
börja lära sig
białka IHF (integration host factor- integralny czynnik gospodarza)
Ile razy genom prokariota może być mniejszy od genomu eukariota
börja lära sig
Tysiące
DNA eukariota jest upakowany między innymi?
börja lära sig
w chromosomach
Ile chromosomów ma człowiek
börja lära sig
46
jaką ma długość DNA w chromosomach
börja lära sig
około kilku cm liniowej cząsteczki
jak wielkie jest jądro Eukariota
börja lära sig
zbliżone do wielkości bakterii
Jak duże stężenie DNA może być
börja lära sig
nawet 200 mg*ml(-1)
Co to chromatyna
börja lära sig
to kompleks DNA i białek (kompleks nukleoproteinowy) tworzący stopień upakowania DNA
ile procent masy chromatyny to białko
börja lära sig
50%
w jakiej fazie najbardziej jest skondensowany chromosom
börja lära sig
w metafazie
w jakiej fazie chromosom jest mocno rozproszony
börja lära sig
w interfazie
Co to histon
börja lära sig
to białka wchodzące w skład chromatyny
na jakie klasy dzielimy histony?
börja lära sig
H2A, H2B, H3 i H4 to histony rdzeniowe oraz H1
co to histony rdzeniowe
börja lära sig
to histon klasy H2A, H2B, H3 i H4
jakie są histony rdzeniowe w porównaniu do H1
börja lära sig
małe białka(mniejsze niż H1), mają masę od 10 do 20 kDa
histony są
börja lära sig
mocno dodatnie ładunkiem (ułatwia to silne wiązania z ujemnym DNA), 20 do 30% to zasadowe aminokwasy lizyna oraz arganina
jaką masę mają histony H1
börja lära sig
23 kDa
ilość histonów H1 jest mniej więcej połowa ilości innych histonów
börja lära sig
ilość histonów H1 jest mniej więcej połowa ilości innych histonów
Nukeaza to?
börja lära sig
Enzym hydrolizujący wiązanie fosfodiestrowe w kwasach nukleinowych
Egzonukleazy uwalniają?
börja lära sig
pojedyńczę nukleotydy z końców nici kwasów nukleinowych
Endonukleazy rozcinają?
börja lära sig
rozcinają wnętrza wiązań fosfodiestrowych
Co powoduje potraktowanie chromatyny nukleazą z mikrokoków?
börja lära sig
Powoduje do izolacji fragmentu DNA o różnej wielkości będącą wielokrotnością około 200 pz.
200 pz jest z czym zasocjowane
börja lära sig
jest zasocjowane histonowym rdzeniem (okręcone wokół rdzenia) z histonów H2a, H2B, H3 i H4 czyli histonów rdzeniowych
Po pierwszym wycięciu chromatyny nukleazą z mikrokoków i pozostawieniu w dalszym trawieniu nukleazą co się stanie
börja lära sig
zostanie struktura zawierająca fragment 146 pz która jest silnie zasocjowana z histonowym oktamerem (histonami rdzeniowymi) wykazuje ona podobieństwo strukturalne niezależnie od miejsca z którego została wycięta
na histonowym rdzeniu oktamerowym mamy ile pz
börja lära sig
mamy 146 pz owijające się 1.8 lewoskrętnego zwoju tworząc superhelikalność
Co to nukleosom
börja lära sig
nukleosom to rdzeń histonowy (oktamerowy) z nawiniętym DNA w 1.8 skrętu czyli z 146 pz
H1 gdzie się przyczepia?
börja lära sig
Przyczepia się do nukleosomu stabilizując miejsce wejścia oraz wyjścia DNA nawijając 20 pz co daje ładnie 166 pz
Czemu odpowiada 166 pz nawiniętych na rdzeń nukleosomu oraz na histon H1
börja lära sig
odpowiada 2 pełnym skrętom
Czemu H1 jest większe?
börja lära sig
bo ma dodatkowy ogon "C-końcowy" który odpowiada za stabilność DNA pomiędzy nukleosomami
Czy histon H1 może być zamieniony na inny?
börja lära sig
W niektórych typach komórek może być zamieniony na swój skrajny wariant na histon H5 który nie ulega transkrypcji.
Co to sznur koralików?
börja lära sig
to nukleosony wraz z DNA łacznikowym które jest cienką nicią DNA która uzupełnia do 200 pz powtarzających się podczas doświadczenia z nukleazą
ule wynosi standardowo DNA łącznikowe?
börja lära sig
Zwykle około 55pz ale może mieć od kilku do nawet 100 pz
czy histon H1 zwiększa organizacje "koralików"?
börja lära sig
Tak wraz z wzrostem stężenia soli aż do powstania włókien średnicy 30nm
Jak nazywa się lewostronna zawinięta helisa wyższego rzędu?
börja lära sig
jest to solenoid
na jeden obrót w solenoidzie przypada ile nukleosomów?
börja lära sig
6 nukleosomów
Długość DNA w pętli eukariota to?
börja lära sig
100 pz w przybliżeniu tyle co u prokariota jednak w chromosomie eukariotycznym mamy znacznie więcej pętli
przez co są końce pętli unieruchomione?
börja lära sig
są unieruchomione przez rusztowanie białkowe lub matriks jądrowy (czyli kompleksy białkowe)
Jak wyglądają wymiary wyższych struktur uporządkowania DNA?
börja lära sig
tworzą się włókna o średnicy 30 nm oraz z nich pętle o szerokości 300nm
w jakiej fazie chromosom jest najbardziej skondensowany?
börja lära sig
w mitozie
przed czym chroni chromosom duże skondensowanie?
börja lära sig
Przed rozerwaniem DNA
Przez co są rozdzielane chromosomy?
börja lära sig
Przez wrzeciono mitotyczne.
Co mamy na końcach chromosomów oraz DNA
börja lära sig
Telomery
Centromer to
börja lära sig
Ograniczony rejon gdzie łącza się dwie chromatydy siostrzane tworząc chromosom
co to kinetochor
börja lära sig
kompleks białkowy przyłączający się do mikrotubul wrzeciona mitotycznego
Co rozdzielają mikrotubule
börja lära sig
Rozdzielają chromatydy podczas anafazy
długość centromeru u drożdży?
börja lära sig
88pz bogatych w AT
Centromer Eukariota ograniczony jest
börja lära sig
satelitarnym DNA (sekwencjami powtarzającymi się)
Co zawiera telomer?
börja lära sig
zawiera setki kopi sekfencji (5-TTAGGG-3 u człowieka)
Co syntetyzuje telomeraza
börja lära sig
sekfencje (5-TTAGGG-3)
co to telomeraza?
börja lära sig
jest to rodzaj rybonukleoproteiny
Co zabezpiecza telomer
börja lära sig
końcówkę chromosomu
Jak uchronić telomer przed skracaniem?
börja lära sig
należy syntetyzować niezależnie telomer
co zachodzi podczas interfazy
börja lära sig
transkrypcja genów na chromosomach oraz replikacja DNA
jak długo trwa faza S (interfaza)
börja lära sig
większość czasu
jaką strukturę przyjmują chromosomy podczas interfazy?
börja lära sig
przyjmują strukturę bardziej rozproszoną nie da się ich rozróżnić
co to heterohromatyna
börja lära sig
jest to część chromatyny w interfazie jaka dalej jest mocno skondensowana jednak nie aż tak silnie jak w metafazie
z czego składa się heterochromatyna
börja lära sig
z satelitarnego DNA jest transkrypcyjnie nieaktywna przykładem jest chromosom X u samic ssaków.
gdzie widzimy heterochromatynę w jądrze pod mikroskopem
börja lära sig
widzimy ją na obrzeżach jądra jako ciemne prążki
Co to Euchromatyna
börja lära sig
pozostała część chromatyny inna niż heterochromatyna
Co się dzieje z Euchromatyną aktywną transkrypcyjnie
börja lära sig
może być bardziej rozproszona już rozwinięta z pętli 30nm aż do sznura koralików czy nawet odwinięta z nukleosomów by łatwo przyłączać czynniki transkrypcyjne
Jaka cześć euchromatyny jest aktywna transkrypcyjnie?
börja lära sig
10%
gdzie znajduje się gen?
börja lära sig
w miejscach aktywnych transkrypcyjnie
jak mapuje się miejsca aktywne transkrypcyjnie?
börja lära sig
szuka się miejsc z nadwrazliwościa na DNazę I czyli deoksyrybonukleazę I
Co robi DNaza I
börja lära sig
rozcina DNA
sygnał do odpowiedniego poziomu upakowania chromosomu w miejscach genów ulegających ekspresji jest?
börja lära sig
metylacja C-5 cytozyny występująca w sekfencji 5-CG-3
powszechnie nazwa metylacji C - 5 cytozyny?
börja lära sig
metylacja CpG
gdzie znajdują się niezmetylowane wyspy CpG?
börja lära sig
W obrębie genów aktywnych transkrypcyjnie
Jak długie są niezmetylowane wyspy CpG?
börja lära sig
2000 pz
co się dzieje z zmetylowaną sekwencją CpG?
börja lära sig
szybko mutuje do TpG z powodu spontanicznej deaminacji 5'-metylocytozyny do tyminy
przykład występowania histonu H5?
börja lära sig
w krwinkach czerwonych ptaków
aktywnej transkrypcji chromatyny towazyszy
börja lära sig
acetylacja reszty lizyny w N-końcowych domenach
co towarzyszy kondensacji chromosomów?
börja lära sig
fosforylacja histonu H1
unikatowe sekwencje DNA
börja lära sig
hybrydyzują wolniej, są często aktywne transkrypcyjnie
tandemowe zespoły genów
börja lära sig
to takie jakie maja sekwencje transkrypcyjną wielokrotnie powtórzona. np geny transkrybujące RNA czy DNA
sekwencje SINES
börja lära sig
krótkie elementy rozproszone od kilkuset pz
sekwencje LINES
börja lära sig
od tysiąca do 5 tysięcy pz (długie elementy rozproszone
najpopularniejsze LINES u człowieka
börja lära sig
sekfencja Alu
długość sekwencji Alu?
börja lära sig
300pz
jak często występuje Alu?
börja lära sig
300000 a 500000 razy się powtarza z 80% 90% procentową powtarzalnością
długość DNA satelitarnego?
börja lära sig
od 2 do 20-30 pz
podział DNA sateliarnego?
börja lära sig
minisatelity oraz mikrosatelity
minisatelity
börja lära sig
tandemowe powtórzenia o zmiennej liczbie powtórzeń VNTR
mikrosatelity
börja lära sig
proste powtórzenia tandemowe STR
gdzie znajdziemy minisatelity VNRT
börja lära sig
najczęściej w pobliżu końca chromosomów
Gdzie znajdziemy mikrosatelity? (SRT)
börja lära sig
wzdłuż całego chromosomu
do czego stosujemy minisatelity
börja lära sig
do zbadania odcisku DNA np w celu sprawdzeniu pokrewieństwa
sekwencja polimorficzna
börja lära sig
to sekwencja inna niż na chromosomie homologicznym lub jeśli występuje inna sekwencja niż standardowa u danego gatunku
SNP
börja lära sig
polimorfizm pojedynczych nukleotydów
SSLP
börja lära sig
polimorfizm długości pojedynczej sekwencji
RFLP
börja lära sig
polimorfizm długości fragmentów restrykcyjnych
dogmat biologii molekularnej
börja lära sig
Z DNA powstaje RNA które tworzy białka
polimeraza RNA co robi
börja lära sig
transkrybuje gen poczynając od promotora a kończąc na terminatorowej sekwencji
RNA kodujący kilka białek to
börja lära sig
RNA polistronicowy
translacja RNA na białko odbywa się w?
börja lära sig
rybosomach
miejsce RNA gdzie koduje kilka białek nazywane jest?
börja lära sig
Operonem
RNA jakie jest tłumaczone w Rybosomach to
börja lära sig
mRNA (messege RNA)
kodon startu to
börja lära sig
kodon inicjatorowy zwykle AUG
tRNA mają funkcje?
börja lära sig
transportują aminokwasy do rybosomów w celu tworzenia białek (tRNA - transport RNA)
jak wygląda ekspresja genów u prokariota
börja lära sig
polimeraza RNA transkrybuje gen następnie przez transkrypcje mRNA i przenoszony do rybosomu tam udział tRNA które donosi aminokwasy. Zwykle sekfencja kodonu inicjatora to AUG przy końcu 5' a terminator jest na końcu 3'
pre-mRNA
börja lära sig
RNA jakie jest transkrybowane w jądrze komórkowym i syntetyzowane przez polimeraze II
pre - mRNA jest transkrybowane przez którą po
börja lära sig
polimeraze II
zwykle u eukariota jest kodowane tylko jedno białko
börja lära sig
miejsca transkrypcyjne są monostronicowe
kapowanie
börja lära sig
czyli dodanie do pre-mRNA ogonu poli (A) na końcu 3' co zwiększa stabilność
introny
börja lära sig
sekwencję przerywające kodowanie białka
splicing
börja lära sig
usuwanie intronów z pre-mRNA i powstanie eksonów
snRNA
börja lära sig
małe jąderkowe RNA
snRNA powstaje?
börja lära sig
w wyniku splicingu

Du måste vara inloggad för att skriva en kommentar.