BIOLOGIA MOLEKULARNA 2

 0    171 fiche    chomikmimi
ladda ner mp3 skriva ut spela Kontrollera dig själv
 
Fråga język polski Svar język polski
Białka, światło?
börja lära sig
Światło o długośi 280 nm
Absorpcja gdzie najwieksza
börja lära sig
dla nukleotydów
Absorpcja gdzie najmniejsza
börja lära sig
dla dsDNA
Od czego zależy współczynnik ekstyncji'?
börja lära sig
Od długości badanej cząsteczki
co znaczy hipochromizm
börja lära sig
mniej barwny
dsDNA o stęż 1mg/ml ile a?
börja lära sig
a260 = 20
RNA i ssDNA ile a?
börja lära sig
a260- 25
co ma wyższy współczynnik ekstynkcji, puryny czy pirymidyny?
börja lära sig
puryny
Topnienie (ogrzewanie) - absorbancja?
börja lära sig
40% wzrost absorbancji
Szybkie ochładzanie - absorbancja?
börja lära sig
Minimalny spadek absorbancji
Wolne ochładzanie - absorbancja?
börja lära sig
Absorbancja bez zmian
Wektor, jaka zdolność
börja lära sig
Zdolność do izolacji od gospodara i replikacji
Fag alfa, zdolność?
börja lära sig
Zdolność do klonowania większych fragmentów
h13 zdolność?
börja lära sig
zdolność do klonowanie fragmentów jednoniciowych
co to kosmid?
börja lära sig
plazmid + fag alfa
Episomalne plazmidy są wektorami dla?
börja lära sig
Są wektorami dla drożdzy
Plazmid Ti wektor dla?
börja lära sig
Roślin
Biblioteki DNA
börja lära sig
zbiory sklonowanych przypadkowo fragmentów genomu DNA/cDNA
Mapowanie restrykcyjne
börja lära sig
analiza fragmentów klonu po cięciu restryktazami
Komórki kompetentne
börja lära sig
są zdolne do przyjęcia obcego DNA przez działanie na nie jonami Ca2+, Mn2+, Rb2+
Transformanty, gdzie najpierw są przechowywane?
börja lära sig
w płynnej pożywce z antybiotykiem (selekcja)
Gdzie po selekcji są przechowywane transformanty?
börja lära sig
Są zamrażane z glicerolem (nie tworzą się kryształy), tzw. zapas glicerolowy
Co robi fosfotaza alkaliczna?
börja lära sig
ten enzym usuwa reszty fosforanowe z 5'
co robi polimeraza DNA I?
börja lära sig
ten enzym odpowiada za syntezez nici z 5->3
co to Fragment klenowa?
börja lära sig
ten enzym to pochodna polimerazy DNA I, brak własciowsci egzonukleazy
Nukleaza fasoli mung co to
börja lära sig
ten enzym trawi jednoniciowe fragmenty naprzeciw pęknięcia nici
ODWROTNA TRANSKRYPTAZA
börja lära sig
Zależna od RNA, synteza DNA komplementarnego do RNA w kierunku 3->5 od startera z 3'OH
czego wymaga odwrotna transkryptaza?
börja lära sig
trifosforanów deoksyrybonukelozydów
co robi RNAza A?
börja lära sig
ten enzym trawi RNA
co robi RNAza H?
börja lära sig
ten enzym trawi RNA hybrydy DNA-RNA
Terminalna transferaza co robi
börja lära sig
ten eznym dodaje nukleotydy do końca 3' a jak GTP to powtaje ogon oligoG
A260/a280 = 1,8 a czystość dna
börja lära sig
Czyste DNA
a260/280 < 1,8 a czystosc DNA
börja lära sig
zanieszczone białkiem
a260/280 > 1,8 a czystosc DNA
börja lära sig
zanieszczyczone RNA
co to Wirowanie izopikniczne
börja lära sig
równowagowe wirowanie w gradiencie stężeń chlorku cezu
Co umożliwia wirowanie izopikniczne?
börja lära sig
Umożliwia analizę DNA i jego oczyszczanie
Gęstość DNA w wirowaniu izopiknicznym?
börja lära sig
1,7g/cm3
Co robi RNA i białka w wirowaniu izopiknicznym?
börja lära sig
RNA w dół, białka flotują(unoszą się)
Jaki barwnik w elektroforezie?
börja lära sig
różowo/pomarańczowy bromek etydyyny
jak zachodzi elektroforeza
börja lära sig
od KATODY (-) do ANODY (+)
Od czego zależy szybkość migracji kolistego DNA w elektroforezie?
börja lära sig
od warunków
Napięcie w elektroforezie
börja lära sig
5-8 V/cm3
Gdzie najlepiej widoczna elektroforeza?
börja lära sig
w RNA
Jakie środowisko zachodzenia elektroforezy?
börja lära sig
W żelu agarozowym (bromek etydyny) lub poliakrydynowym (AgNO3/SYBR)
co to metoda gRTPCR?
börja lära sig
real time, analiza ilości produktów w czasie rzeczywistym
czego używa się w gRTPCR?
börja lära sig
SYBR
cechy SYBR
börja lära sig
nietoksyczny i silnie wiążacy DNA
Kiedy zachodzi analiza w gRTPCR?
börja lära sig
analiza w czasie trawienia
czego analiza w gRTPCR?
börja lära sig
Analiza polimorfizmu pojedynczych nukleotydów
Co jest znakowane w gRTPCR?
börja lära sig
nukleotydy i sondy
Elektroforeza mikrokapilarna
börja lära sig
z wykorzystaniem macierzy
Elektroforeza kapilarna
börja lära sig
w wolnym buforze, niewielkie cząsteczki, z cienkiej kapilarze kwarcowej
W żelu poliakrydynowym elektoforeza (PZ)
börja lära sig
5-1000 pz (gRTPCR)
w żelu agarozowym elektroforeza
börja lära sig
0,1 - 20 kpz
w polu pulsacyjnym elektroforeza
börja lära sig
20kpz - 10 Mpz, oddziela cząsteczki wielkości 100kpz
Choroba takahary, inna nazwa
börja lära sig
alaktazemia
jaki gen, choroba Takahary?
börja lära sig
Gen kontrolujący syntezę katalazy, krótkie ramie chromosomu 11 (11p13)
jak dziedziczona alaktazemia?
börja lära sig
autosomalnie recesywnie
Na czym polega alaktazemia?
börja lära sig
Redukcja aktywnośći katalazy
gdzie najczęściej alaktazemia?
börja lära sig
Najwyższa częstość występowania mutacji w Japonii
Objawy alaktazemii
börja lära sig
Owrzodzenie śluzówek jamy ustnej, podudzi, oraz wczesne wypadanie zębów
Cholinoesteraza
börja lära sig
gen na 3 chromosomie i tam mutacja
Wrażliwość na chlorek suksametonium, objawy?
börja lära sig
zwiotczenie mięśni, efekt szybki ale też szybko zanika. (za objawy odpowiada hydroliza sukcynylocholiny)
za hydrolizę sukcynylocholiny odpowiedzialna jest?
börja lära sig
cholinoesteraza
Jak dziedziczona hipertermia złośliwa?
börja lära sig
autosomalnie dominująco
Przez co wywoływana hipertermia złośliwa
börja lära sig
leki znieczulenia ogólnego: antystetyki wziewne, dożylne, leki zwiotczające, glikozydy naprastnicy
Objawy hipertemia złośliwa
börja lära sig
wzrasta napięcie mięsni prązkowanych, drzenie mięsniowe, pojawa się tachykardia i wzrost temperatury ciała(1 stopien w ciagu 5 min)
Mutacja genu 19q13.1
börja lära sig
Koduje receptor rianodynowy uwalniajacy wapń z retikulum do cytoplazmy ->hipertermia złośliwa
Jak dziedziczona hipertermia złośliwa?
börja lära sig
autosomalnie dominująco
Alaktazemia jaki gen
börja lära sig
11p13
jak dziedziczona alaktazemia?
börja lära sig
autosomalna recesywna
Metaboizm alkoholu etylowego, jakie enzymy?
börja lära sig
Dehydrogenaza alkoholowa ADH i dehydrogenaza aldehydowa ALDH
gdzie dehydrogenaza alkoholowa ADH?
börja lära sig
chromosom 4
gdzie dehydrogenaza aldehydowa ALDH?
börja lära sig
1-chromosom 9, 2-chromosom 12
Porifiryny
börja lära sig
prekursory hemu i składniki enzymów
na jakie dzielimy porifiryny
börja lära sig
na wątrobowe i erytropoetyczne
Porfirie, na czym polega
börja lära sig
Deficyt enzymów biorących udział w przemianach porfiryn
Jak dziedziczone porfirie?
börja lära sig
Autosomalnie dominująco
Krzywica odporna na wit D3, jaki gen?
börja lära sig
gen VDR dominująco w sprzężeniu z chromosomem X
Niedobór dehydrogenaza glukozo-6-fosforanowej, jaki chromosom
börja lära sig
chromosom X
niedobór alfa-1-antytrypsyny, jaki gen i chromosom
börja lära sig
Gen PI, chromosom 14
niedobór paraoksonazy, gen + chromosm
börja lära sig
gen PON1 na chromosomie 7 sprzeżony z genem CFTR
Hemochromatoza, jaki gen
börja lära sig
gen HFE na chromosomie 6, autosomalnie recesywnie
hipolaktazja, jaki gen
börja lära sig
3 allele na chromosomie 3
fenyloketonuria, jaki gen
börja lära sig
12q24.1
Jak dziedziczona fenyloketonuria?
börja lära sig
autosomalnie recesywnie
Co wywołuje ostrą porfirie?
börja lära sig
Lek, infekcje, głodzenie, duży wysiłek fizycnzy
Jakie leki wywołują ostrą porfifrie?
börja lära sig
barbiturany, sulfonamidy, przeciwbólowe, antykoncepcyjne, antybiotyki, alkaloidy sporyszu, etanolu,
Kiedy forma enolowa?
börja lära sig
w pH zasadowym
Kiedy forma ketonowa?
börja lära sig
w ph obojętnym
Co to sonikacja?
börja lära sig
Działanie ultradźwiękiem o dużej intensywności na DNA
Do czego prowadzi sonikacja?
börja lära sig
Do uszkodzenia DNA i zmniejszenia jego lepkośći
Podział zasad
börja lära sig
Puryny i pirymidyny
Puryny
börja lära sig
adenina i guanina (2 pierścienie)
Pirymidyny
börja lära sig
cytozyna, tymina, uracyl (1 pierścien)
Co to liza alkaliczna?
börja lära sig
Metoda oczyszczania plazmidowego DNA z chromosowego DNA i innych
Plazmidy
börja lära sig
Autonomiczne, pozachromosome elementy genetyczne
W jakiej postaci występują Plazmidy?
börja lära sig
w postaci kolistych/liniowych cząsteczek DNA
gdzie wystąpują Plazmidy?
börja lära sig
u prokariotów i niektórych eukariotów
Jaka zdolnosc maja plazmidy?
börja lära sig
Zdolność do trwałego utrzymywania się i replikowania w komórce
Plazmidy a chromosomy gospodarza
börja lära sig
Są odrębne od chromosomów gospodrza
Jaką struktuę tworzą plazmidy?
börja lära sig
CCC-DNA
co robi CCC-DNA?
börja lära sig
wykazuje negatywne superskręcenie
Jakie plazmidy nie tworzą struktury CCC-DNA?
börja lära sig
Plazmidy izolowane z hypertermofilnych Archaea, u których jest pozytywne superskręcenie cz. DNA
wielkość plazmidów
börja lära sig
od 1000 pz do 1,7 Mpz
Gdzie najmniejsze plazmidy?
börja lära sig
U Heamophilus somnus, Mycoplasma i Helicobacter pylori
Gdzie największe plazmidy?
börja lära sig
u Rhizobium
Gen kodujący białko (plazmidy)
börja lära sig
30 kDa - 1 kpzC
Co zawierają plazmidy?
börja lära sig
Region początku replikacji
Jakie geny często zawierają plazmidy?
börja lära sig
odporności, np. gen bla / ampr
Co robi gen bla/ampr?
börja lära sig
Koduje beta-laktamaze, która rozkłada antybiotyki penicylowe
NORTHERN BLOT
börja lära sig
dla transferu rozdzielonego elektroforetycznie DNA
SOUTHERNBLOT
börja lära sig
osmoza do wymuszenia węrdrówki soli z pociąganiem DNA ze sobą
WESTERN BLOT
börja lära sig
dla transferu białka
EASTERN BLOT
börja lära sig
dla transferu białek po ich rozdziale w elektroforezie dwukierunkowej
DNA/RNA w środowisku kwasowym
börja lära sig
hydroliza
DNA/RNA w środowisku lżej kwasowym (3-4)
börja lära sig
hydroliza wiązan glikozydowych, kwas apurynowy
DNA/RNA w środowisku zasadowym
börja lära sig
denaturacja (RNA i DNA), hydroliza (RNA, bo ma 2-OH')
Co jest bardziej podatne na hydrolize? DNA czy RNA?
börja lära sig
ZAWSZE RNA
Multipleks PCR
börja lära sig
ampliflikacja równoczesna
Nested-PCR
börja lära sig
wewnętrzna/gniazdowa, gdy mało matryc
RT-PCR
börja lära sig
przepisanie sekwencji z MRNA składającego się z samych eksonów na cDNA - stwierdzanie obecności określonych transkryptów
STS-PCR
börja lära sig
Umożliwia indentyfikację poszczególnych loci dzięki amplifikacji fragmentu DNA pomiędzy parą starterów o znanej sekwencji
STS – ile pz?
börja lära sig
200-300 pz
Zagęszczanie map genetycznych, jaka metoda
börja lära sig
STS-PCR
Poszukiwanie sprzężen z cechami genotypowymi, jaka metoda
börja lära sig
STS-PCR
do uporządkowania bibiloteki genomowej w KONTIGI, jaka metoda?
börja lära sig
STS-PCR
RACE-PCR
börja lära sig
szybka amplifikacja końców Cdna, poznanie dokładnej sekwencji jednego z końców
ASA=PASA=ASP=ARMS
börja lära sig
amplifikacja alleo-specyficzna, wykrywa polimorfizm alleli i mutacji punktowych
ASO
börja lära sig
połączenie hybrydyzacji i PCR
co robi sonda w ASO?
börja lära sig
sonda rozponzacje allel prawidłowy/zmutowany
OLA
börja lära sig
badanie ligacji oligonukleotydów, połączenie PCR i ligacji DNA
REP-PCR
börja lära sig
wykorzystanie sekwencji repetytywnych
AS-PCR
börja lära sig
asymetryczne PCR, amplifikowana tylko 1 nić, na 3' fluorochrom
I-PCR
börja lära sig
odwrócona PCR, DNA oskrzydla znana sekwencje
PCR in situ
börja lära sig
z udziałem znakowanych nukleotydów, czuła i kosztowna
RAPD-PCR
börja lära sig
losowa amplifikacja polimorficznego DNA, umożliwia jednoczesną detekcję polimorfizmu wielu loci w całym genomie
Jaka ilość DNA wyjściowego w RAPD-PCr?
börja lära sig
mała
W jakiej metodzie PCR wykyrywane loci mają dominujący charakter?
börja lära sig
w RAPD-PCR
W jakiej metodzie nie można odróżnić homozygot od heterozygot?
börja lära sig
w RAPD-PCR, bo wizualizacja tylko jednego z dwóch alleli
Badanie jakiego materiału jest zalecane przy RAPD-PCR?
börja lära sig
Haploidalnego materiału
W jakiej metodzie badanie zróżnicowania DNA jądrowego między osobnikami i populacjami?
börja lära sig
RAPD-PCR
Jaka metoda umożliwia szybkie określenie liczby chromatyny X i Y w jądrach interfazowych?
börja lära sig
FISH
FISH umożliwia zlokalizowanie jakich sekwencji DNA?
börja lära sig
nieswoistych sekwencji DNA bezporśrednio w materiale genetycznym
Jakie zmiany bada FISH?
börja lära sig
Zmiany ilościowe w liczbie i strukturze chromosomów
Metoda oparta na fish
börja lära sig
cytogenetyka interfazalna
Do czego hybrydyzacja typu northern?
börja lära sig
do analizy RNA i procesu transkrypcji poszczególnych genów
Ustalanie, które geny uległy transkrypcji w badanych tkankach - jaka metoda
börja lära sig
Hybrydyzacja typu northern
Ustalanie, które geny uległy transkrypcji na danym etapie rozwoju - jaka metoda?
börja lära sig
hybrydyzacja typu northern
Poznanie czego jest możliwe dzięki hybrydzacji typu northern?
börja lära sig
Poznanie długości RNA i intensywność jego transkrybcji
Hybrydyzacja RNA-DNA jaka metoda
börja lära sig
northern
Hybrydyzacja DNA-DNA jaka metoda
börja lära sig
southern
HGP
börja lära sig
projekt poznania ludzkiego genomu
knockout
börja lära sig
pozbawienie zwierzęcia doświadczalnego określonego typu
genomika porównawcza
börja lära sig
porównawcza analiza różnych genotypów
proteomika
börja lära sig
wiedza o zespolach bialek wytwarzanych przez komórki, tkanki, narządy
transkryptomika
börja lära sig
badanie regulacji ekspresji genów na poziome transkrypcji
gdzie znalezione enzymy restrykcyjne?
börja lära sig
jedynie w komórkach bakterii i sinic
Enzym restrykcyjny jakie sekwencje rozpoznaje?
börja lära sig
Speficzyne sekwencje dwuniciowego DNA o długości 4-8 par zasad
Aktywność STAR
börja lära sig
niespecyficznośćenzymów restrykcyjnych w niektórych warunkach
kiedy aktywność star?
börja lära sig
kiedy trawienie przeprowadza sięwinnych warunkach niż optymalnie
Enzym EcoRI a zmienione warunki
börja lära sig
zmienione warunki mogę uniemożliwić wykrycie struktury GAATTC, którą normalnie rozpoznaje
co to optymalne warunki trawienia
börja lära sig
odpowiednie Ph, stęzenie jonów magnezu
Co pozostawiją enzymy restrykcyjne?
börja lära sig
Końce tępe i lepkie w cząsteczce
Gdy obie nici rozcięte są naprzeciwko siebie równolegle, powstają
börja lära sig
tępe końce
Gdy jednoniciowe sekwencje wystepujace na obu koncach sa przeciete niesymetrycznie, powstaja
börja lära sig
lepkie konce
Restryktazy czworkowe
börja lära sig
rozpoznaja sekwencje DNA co 256pz
Restryktazy szostkowe
börja lära sig
Rozpoznaja sekwencje DNA co 4096 pz
Izoschizomery
börja lära sig
enzymy pochodzące z różnych szczepów bakterii, ale rozpoznające te same sekwencje DNA
Egzonukleazy
börja lära sig
umożliwiaja odpowiednią modyfikacje koncow we fragmentach DNA
polimerazy
börja lära sig
odpowiedzialne za amplifikację odpowiednich odcinkow DNA

Du måste vara inloggad för att skriva en kommentar.