27

 0    184 fiche    chomikmimi
ladda ner mp3 skriva ut spela Kontrollera dig själv
 
Fråga język polski Svar język polski
Genom człowieka to
börja lära sig
mat. genetyczny zawarty w haploidalnym zestawie chromosomow (n=23)
Na genom czlowieka składają się
börja lära sig
1) DNA w jądrze, dna genomowe (gDNA) oraz 2) DNA mitochondrialny (mt DNA)
gDNA zawiera
börja lära sig
3,08 miliardów nukleotydów
Eksony stanowią
börja lära sig
1,5% dna
Introny stanowia
börja lära sig
25,5 % Dna
DNA niekodujący stanwoi
börja lära sig
73% dna
mtDNA występuje
börja lära sig
w postaci kolistych cząsteczek w macierzy mitochondriów
Dzięki technikom klonowania staje się możliwe
börja lära sig
uzyskiwanie dużych ilosci materialu do badan sekwencyjnych
Enzymy restrekcyjne tworzą
börja lära sig
system obronny bakterii i sinic przed infekcją z udziałem wirusów bakteryjnych i bakteriofagów
Enzymy restrykcyjne tnące DNA w miejscu specyficznych sekwencji, dł.
börja lära sig
Długość zależy od odległości między sekwencjami rozpoznawanymi przez enzym
Identyfikacja miejsc rozpoznawanych przez różne enzymy restrykcyjne pozwala na
börja lära sig
skonstruowanie mapy restrykcyjnej
Nazwy enzymów tworzy się
börja lära sig
od 1 litery nazwy rodzajowej i 2 liter nazwy gatunkowej
1 jednostka enzymu restrykcyjnego oznacza
börja lära sig
taka jego ilosc, ktora katalizuje kompletną hydrolizę wiązan w cz. fazowego dna u masie 1ug(50kpz) w ciagu 1 godz i w temp. 37 stopni
Rozpoznawana sekwencja: ecori
börja lära sig
5' g/aattc 3', 5' jest lepkim koncem
Rozpoznawana sekwencja: Hae III
börja lära sig
5' GG/CC 3', powstaja tepe konce
Rozpoznawana sekwencja: HhaI
börja lära sig
5' GCG/C 3', 3' jest lepkim koncem
ECORV Rozpoznawana sekwencja:
börja lära sig
5' GAT/ATC 3', powstają tepe konce
Rozpoznawana sekwencja: taqI
börja lära sig
5' t/cga 3', 5' jest lepkim końcem
Rozpoznawana sekwencja: NotI
börja lära sig
5' gc/ggccgc 3', enzym rozpoznający 8-nukleotydową sekwencję
Lepkie końce 3' tworzone przez enzymy restrykcyjne
börja lära sig
złożone z 2-4 nukleotydów
Lepkie końce 5' tworzone przez enzymy restrykcyjne
börja lära sig
złożone z 2-6 nukleotydów
Izoschizomery
börja lära sig
Enzymy pochodzące z różnych szczepów bakterii, ale rozpoznające te same sekwencje DNA
Lepkie końce
börja lära sig
1niciowe sekwencje wystepuja na obu koncach czasteczki przeciete niesymetryczne
Fragmenty DNA powstałe po trawieniu restryktazami można
börja lära sig
rozdzielac elektroforetycznie
Po elektroforezie, jaki rozklad dna?
börja lära sig
liniowy rozklad otrzymanych fragmentow od najmniejszych do najwiekszych
Na tej samej wysokosci zelu znajduja się
börja lära sig
fragmenty identycznej wielkości, co zwykle odpowiada takiej samej sekwencji nukleotydowej
Mapa restrykcyjna
börja lära sig
wzajemne ułożenie miejsc
wzór restrykcyjny
börja lära sig
tworzony przez wielkosc fragmentow otrzymanych po trawieniu enzymami
Ligacja lepkich/tepych koncow jest wydajniejsza?
börja lära sig
Lepkich, bo pomiedzy komplementarnymi 1-nicowymi fragmentami lepkich k. tworza sie wiazania wodorowe, co ulatwiaja ligacje
Fragmenty DNA powstałe po cięciu okreslonym enzymem moga bzostac polaczone z innym DNA
börja lära sig
wektorem, trawionym tym samym enzymem
Końce DNA badanego i DNA wektora
börja lära sig
są sparowane komplementarnymi nukleotydami i mogą być łączone za pomocą ligazy
Wbudowany fragment DNA to
börja lära sig
wstawka
Wektory autonomiczne
börja lära sig
replikują się niezależnie od genomu gospodarza
Wektory integracyjne
börja lära sig
włączają się do DNA gospodarza i są bardziej stabilne, ale występuja w mniejszej liczbie kopii
Wektory retrowirusowe mogą spowodobac
börja lära sig
Wektory retrowirusowe mogą spowodobacintegracje sekwencji przenoszonej w wektorze z genomem gospodarza
Wektory ekspresyjne
börja lära sig
zapewniają wydajną ekspresję klonowanej sekwencji
Wektory bifunkcjonalne
börja lära sig
mogą występować w co najmniej 2 różnych organizmach, przy czym istnieje możliwoc przeniesienia wektora z komorki prokariotycznej do eu. i vice versa
Najwazniejszym elementem warunkujacym efektywnosc wektora sa
börja lära sig
sekwencje ori, odpowiedzailne za rozpoczęcie replikacji
Jeśli wektor za wstawka bedzie namnazy w kom. bakterii lub drozdzy to musi...
börja lära sig
posiadac sekwencję ori obydwu organizmów
Miejsca cięcia dla enzymów restrykcyjnych powinny znajdować się
börja lära sig
w obrębie markerów selkcyjnych MCS, co umożliwia identyfikację komórek, do ktorych wniknal zrekombinowany wektor
Plazmid to
börja lära sig
pozachromosomowa, zwykle kolista cz. DNA, wielkosc od kilku do kilkuset t. pz, zdolna do samodzielnej replikacji
Wielkosc wstawki, plazmid
börja lära sig
15 kpz
wielkosc wstawki, wektory fagowe
börja lära sig
ok 25 kpz
wielkosc wstawki kosmidy
börja lära sig
45 kpz
wielkosc wstawki PAC
börja lära sig
150 kpz
wielkosc wstawki BAC
börja lära sig
500 kpz
wielkosc wstawki YAC
börja lära sig
1 000 kpz
Bakteriofagi
börja lära sig
wirusy infekujące bakterie przez wstrzykniecie swojego DNA do wnetrza kom, bakteryjnej, stosowane jako wektory
W budowie bakteriofagów rozroznia sie
börja lära sig
dwuniciowy dna lub rna otoczony białkiem kapsydu
fag λ
börja lära sig
48 kpz, infekuje E. coli, wstrzykuje 2niciowy liniowy DNA do komórki, w ktorej przeksztalca sie w forme kolistą(umożliwiają to sekwencje cos znajdujace sie na koncach liniowego DNA faga)
Wektory typu replacement ("z zastąpieniem")
börja lära sig
rodzaj wektora lambda, gdy region genomu faga podlega wymianie na obce DNA
wektory typu insercyjnego
börja lära sig
wektory rodzaj lambda, gdzie wbudowywany fragment obcego dna zawiera się w granicach do 8 kpz
pochodnymi faga λ są
börja lära sig
charony, centralna cz. bakteriofaga λ ktora nie jest niezbedna moze byc usunieta i zastapiona obcym DNA
Pochodne faga M13 charakteryzuje
börja lära sig
szczególny cykl zyciowy, pozwalajacy na wykorzystanie go do wytwarzania jednonicowego DNA
M13
börja lära sig
fag podłużny, nitkowaty, 6400pz, nie powoduje lizy, lecz jest uwalniany z zyjacych kom. bakteryjnych
Po wstrzyknieciu DNA faga m13 do komorek bakteryjnych
börja lära sig
syntetyzowana jest druga nic DNA
Kosmid budowa
börja lära sig
skladaja sie z sekwencji plazmidu bakteryjnego z genem ori, polaczonych z sekwencją cos faga λ, ktora jest konieczna do pakowania DNA do wnętrza kapsydów fagowych
Kosmid infekuje
börja lära sig
komórki bakteryjne podobnie jak fag λ, a jego DNA replikuje jak DNA plazmidu
Pac
börja lära sig
Rozbudowana wersja kosmidu, sztuczny chromosom wyprowadzony z faga p1, o wielkosci 19,5 kpz
YAC
börja lära sig
sztuczne chromosomy drozdzy, CEN4 , TEL, ARS zostały wyizolowane i polaczone z plazmidami skonstruowanymi dla E. coli
CEN4
börja lära sig
Sewkencje drozdzowe centromeru
TEL
börja lära sig
sekwencje drozdzowe telomeru
ARS
börja lära sig
miejsca poczatku replikacji
BAC
börja lära sig
zrekombinowane DNA bazujace na DNA plazmidu F bakterii E. coli
BAC i YAC służą do
börja lära sig
lokalizacji nowych genów i poszukiwania nowych sond DNA
Wektorami używanymi do klonowania w komorkach ssakow sa
börja lära sig
wektory eukariotyczne oparte na wirusach.
Transformacja
börja lära sig
wbudowania zrekombinowanego wektora do komórki gospodarza
komórki kompetentne
börja lära sig
odpowiednio przygotowane na przyjęcie DNA
Elektroporacja
börja lära sig
silny impuls elektryczny powodujacy przejsciowe utworzenie w bl. kom. mikroporów, przez ktore moze przenikac zrekombinowany DNA
Po transformacji bakterie wysiewa się na
börja lära sig
odpowiednie podłoże selekcyjne. Selekcja opiera się na obecności w wektroze genów markerowych
geny markerowe w wektorze nadaja
börja lära sig
transformantom określony fenotyp
Selekcja po transformacji, bakterie
börja lära sig
1) umiejscowanie w plazmidzie 2 genów odporności, 2) test alfa-kompetencji
Umiejscowowienie w plazmidzie 2 genów odporności
börja lära sig
kazdy z genow odpowiada za opornosc na inny antybiotyk, przy czym 1 z nich ma fragment do klonowania. Komorka, ktora plazmidu nie pobrala bedzie wrazliwa na oba antybiotyki.
Test alfa-komplementacji
börja lära sig
Bakterie ktore pobrały zrekombinowy plazmid, kolor bialy. Bakterie gdzie komplemetnacja mutacji, niebieskie
Polilinkery wektorow sa umiejscowione
börja lära sig
w obrebie genu kodujacego enzym B-galaktozydaze.
Dzięki bibliotece cDNA można uzyskac infromacje
börja lära sig
o genach aktywnych w danym typie komórek lub tkanek
PCR odzwierciedla
börja lära sig
naturalny proces replikacji i umożliwia powielenie wyhbranych odcinków kwasów nukleinowych
Sposoby usuwania białek (odbiałczania) preparatu
börja lära sig
1) z zastosowaniem fenolu i chloroformu, wskutek wysolenia białek z lizatów komórek, po związaniu DNA z nośnikiem
Sposoby usuwanie białka: po związaniu DNA z nośnikiem
börja lära sig
Używane są kolumny chromatograficzne z filtrami jonowymiennymi lub krzemionkowymi
320nm
börja lära sig
tło i możliwe kontaminacje
Elektroforeza preparatywna umożliwia
börja lära sig
izolację z żelu tej cz. preparatu, która jest niezbędna do dalszych prac. Do tego celu stosuje się różne techniki elucji
Elektroforeza analityczna słuzy do
börja lära sig
charakterystyki badanego preparatu na danym etapie dośiwadczenia.
Rozkład frakcji rybosomalnych moze byc wykorzystywany jako
börja lära sig
orientacyjny marker mas czasteczkowych, gdyzy znane sa wielkosci podstawowych frakcji
Wielkość 18s
börja lära sig
1,9 kpz
wielkość 28s
börja lära sig
5,0 kpz
Bromek etydyny, co robi
börja lära sig
interkaluje pomiędzy pary zasad, powodujac intensywną fluorescencję w świetle UV
Barwienie bromkiem etydyny umożliwia wizualiację DNA w ilości
börja lära sig
10 ng w pojedynczym brążku
Kompleks SYBr-dna ma maksiumum absorpcji... maksiumum emisji
börja lära sig
Absorpcji: dlugosc fali 498nm(niebieski), emisji: 522nm (zielony)
Do rozdzielenia duzych czasteczek DNA, od 20 kpz do 10 mpz stosuje sie
börja lära sig
elektroforezę w polu pulsacyjnym
Elektroforeza w polu pulsacyjnym
börja lära sig
Pole elektryczne jest włączane i wyłączane w krotkich odstepach czasu, zmieniajac kierunek pola elektrycznego o 90 lub 180.
Elektroforeza kapilarna służy do
börja lära sig
rozdziału niewielkich czasteczek kwasow nukleinowych; zwana inaczej elektroforezą w wolnym buforze
Podstawowe techniki wykorzystujace rozdzial w kapilarach objete sa
börja lära sig
ogolnym pojeciem wyskosprawnej elektroforezy kapilarnej HPCE
Elektroforetyczne przenoszenie (elektotransfer)
börja lära sig
Przenoszenie cz. kwasów nukleinowych rozdzielonych uprzednio w żelu na wiazace je nosniki
Podczas zwyklej elektroforezy prad plynie
börja lära sig
wzdłuż łaszczyzny żelu, przyczynaiajc sie do rozdzialu czas.
W transferze elektroforetycznym prąd płynie
börja lära sig
przez całą grubość żelu przyczyniając się do efektywnego przeniesienia cz. z żelu na bibułę lub różne rodzaje membran nałożonych n ażel.
Transfer na membrany można przeprowadzić z wykorzystaniem
börja lära sig
sił kapilarnych
Hybrydyzacja to
börja lära sig
tworzenie podwójnej helisy między komplementarnymi niciami DNA lub RNA pochadzącymi z różnych źródeł. Dna najczęściej bada się w postaci fragmentów pojedyczych nici.
Sonda molekularna
börja lära sig
Druga część powstającej hybrydy znajdujaca sie w roztworze hybrydyzacyjnym
Sondami molekularnymi moga byc
börja lära sig
fragmenty 1-niciowego dna/rna/cdna, syntetyczny oligonukleotyd, sonda utworzona dzieki amplifikacji PCR
Sondy można znakować
börja lära sig
radioaktywnie, nieradioaktywnie, immunochemicznie, enzymatycznie
Wykrycie sygnały sondy po hybrydyzacji jest możliwe
börja lära sig
dzięki jej znakowaniu.
Znakowanie sondy: radioaktywnie
börja lära sig
do sondy włączany jest nukleotyd znakowany radioaktywnym izotpoem, detekcja opiera się na naświetlaniu klisz wrażliwych na promieniowanie w procesie autoradiografii
Znakowanie sondy: nieradioaktywnie
börja lära sig
np. metodami fluorescencyjnmi, za pomocą emisji swiatla o okreslonej dlugosci fali i roznego typu fluorochromów
Znakowanie sondy: immunochemicznie
börja lära sig
do sondy włącza sięnukleotyd sprzężony z haptenem(biotyna, digoksygenina, fluoresceina)
Znakowanie sondy: enzymatycznie
börja lära sig
do sondy włączany jest nukleotyd sprzezony z czasteczka enzymu
Hybrydyzacja in situ wykorzystywana
börja lära sig
do rozmazów komkórkowych lub skrawków tkanek po ich odpowiednim przygotowaniu celem odsłonięcia i denatruacji kwasów nukleinowych, a tym samym uzyskania mozliwosci laczenia sie ich nici z sek. komp. sondy
Dot blot
börja lära sig
Odmiana Southern, pozwala na jednoczesne wykrywanie i identyfikację wielu probek DNA na tym samym filtrze
Slot blot
börja lära sig
zamiast nakrapiania na membranę, stosuje się specjalnie przygotawny wzorzec szczelin, do ktorych nanosi sie DNA
slot blot może byc wykorzystywana
börja lära sig
jako analiza ilościowa przy założeniu wprowadzenia przed hybrydyzacją wzorców ilości użytego DNA
Hybrydyzacja kolonijna
börja lära sig
na membranie umieszcza się kolonie bakteryjne zawierające poszczególne klony. Po transformacji komórek bakteryjnych zmodyfikowanym plazmidem i wysianiu na szalki Petriego replikuje się kolonie na filtr.
Co po replikowaniu koloni na filtr? hybrydyzacja kolonijna
börja lära sig
poddaje się hybrydyzacji i autoradiogrofii
Hybrydyzacja łysinkowa
börja lära sig
Po transformacji komórek bakteryjnych wektorem fagowym i wysianiu ich na szalki petriego replikuje się na kolonie na filtr.
Co po przeniesieniu koloni na filtr? hyb. łysinkowa
börja lära sig
Przytwierdza się przeniesione fagi do filtru i hybrydyzuje z sondą, a nastepnie poddaje autoradiografii.
Makromacierze, działanie
börja lära sig
naniesienie na nosnik licznych wzorcowych sekwencji bedacych podłożem do hybrydyzacji materiału badanego.
Mikromacierze ekspresyjne zawierają
börja lära sig
11-20 sond oligonukleotydowych obejmujących fragmenty 3' kazdego ze znanych transkryptow danego organizmu
Mikromacierze eksonowe zawierają
börja lära sig
sondy homologiczne dla poszczególnych eksonów danego transkryptu
Mikromacierze dachówkowe (równomiernie pokrywające genom) umożliwiają
börja lära sig
identyfikację miejsc wiązania sie czyn. transkrypcyjnych, modyfikacji histonow, metylacji Dna i inne zwiazane z reg. transkrypcji.
Chip-chip pozwala na
börja lära sig
jak czesto i w jakich miejscach genomu wiązane są konkretne białka, co stwarza mozliwosc stowoistego mapowania interakcji bialko-DNA.
PRINS
börja lära sig
synteza in situ przy udziale startera.
Princs, jak działa
börja lära sig
Hybrydyzacja nieznakowana sondą z wykrywaniym od. kwasu nuklei., a nastepnie wprowadza się polimerazę DNA i znakowane nukleotydy.
Diagnostyka preimplantacyjna blastomerów uzyskanych drogą biopsji zarodka, co się uzywa, jakich metod?
börja lära sig
PRINCS i pcr
Mikromacierze wykorzystywane do:
börja lära sig
analizy trasnkryptomicznej(RNA), badania: DNA, sekwencji genów, oddziaływania DNA z białkami, modyfkiacja chromatyny chip-chip, analiza SNP
CGH nie!!! może służyć do
börja lära sig
wykrywania aberracji zrównoważonych (tylko niezrównoważone)
mikromacierz CGH (array CGH), czym sie rozni od CGH?
börja lära sig
Zastąpiono chromosomy metafazowe oligonukleotydami lub grafmentami DNA(jak bac/pac)
CGH mechanizm działania
börja lära sig
na szkiełku utrawala prawidłowo dzielące się komórki, z kom. badanych izoluje się DNA, to DNA hybrydyzuje się w mieszaninie z DNA kontrolnym 1:1
W technice RT-PCR reakcję poprzedza
börja lära sig
przepisanie sekwencji zawartej wyłącznie w dojzałym mRNA, a wiec powstalym tylko na bazie eksonow, na cDNA.
EST
börja lära sig
znaczniki ekspresji; kopiujac mRNA uzyskuje sie kilkusetnukleotydowe fragmenty DNA, z ktorej mRNA byl transkrybowane
EST reprezentują
börja lära sig
znaną, unikatową sekwencję klonu cDNa
IVTT = PTT
börja lära sig
test syntezy białka in vitro, służy do badania produktu reakcji RT-PCR
RAPD-PCR
börja lära sig
technika losowej amplifikacji polimorficznego DNA
RAPDpPCR umożliwia
börja lära sig
równoczesną detekcję polimorfizmu wielu loci w całym genomie
w LCR stosuje się
börja lära sig
powielanie in vitro fragmentu kwasu nukleinowego w wyniku wielokrotnego powtórzenia reakcji ligacji 2 oligonukleotydów
Metoda LCR pozwala na
börja lära sig
analizę mutacji genów
Różnica między PCR a LCR
börja lära sig
zastosowanie w LCR 4, a nie 2 starterów + posiada termostabilną ligazę
MLPA
börja lära sig
Reakcja łańcuchowej polimerazy, pozwalającą na względnie równoczesną i ilościową ocenę do czterdziestu sekwencji nukleotydowych.
HRM
börja lära sig
analiza krzywych topnienia DNA. Jeśli mutacje, krzywa topnienia ma nieco inny przebieg niz prawidłowa.
W MLPA amplifikacji ulega
börja lära sig
sondy, które podlegają hybrydyzacji z badanym fragmentem DNA, a nastepnie ligacji.
MLPA- po ligacji
börja lära sig
powstają matryce do reakcji multipleks PCR. W przypadku delecji 1 z alleli uzyskuje się o 1/2 mniejszą ilośćmatrycy.
MLPA - 1 sonda każdej pary zawiera
börja lära sig
między sekwencją komplementarną do badanego DNA dodatkową sekwencję, tzw. łącznik
MLPA - w każdej z poszzcególnych par sond, sekwencja łącznika...
börja lära sig
ma różna, zdefiniowaną długość, co umożliwia w czasia rozdział elektroforetyczny i identyfikację fragmentów na podstawie ich długości.
GAP-LCR
börja lära sig
odmiana LCR, gdzie stosuje się jednoczesnie ligazę i polimerazę DNA
w reackji GAP-LCR między oligonukleotydami hybrydyzujacymi z dna powstaje
börja lära sig
przerwa, ktora zostaje uzupelniona przy udziale polimerazy DNA.
PCR-SSCP
börja lära sig
Analiza polimorfizmu konformacji pojedynczej nici. Obie nici poddaje się denaturacji.
PCR-DGGE
börja lära sig
Zamiast denaturacji przed rozdziałem elektroforetycznym badanej cz. DNA mozna zastosowac czynnik denaturujacy zawarty bezposrednio w zelu
PCR-TGGE
börja lära sig
Zamiast denaturacji przed rozdziałem elektroforetycznym badanej cz. DNA gradient temperatury jako cz. denaturujacy
HA
börja lära sig
analiza heterodupleksów
CMC
börja lära sig
chemiczne rozszczepianie niesparowań heterodupleksów
Odmianą HA jest
börja lära sig
denaturująca wysokosprawna chromatografia cieczowa DHPLC
DHPLC wykorzystuje
börja lära sig
wysoka rozdzielczosc nowoczesnych wyplenien kolumn chromatograficznych, czulosc siega 100%
pirosekwencjonowanie
börja lära sig
na kazdym etapie syntezy dna jest inkubowane w obecnosci: polimerazy DNA, sulfurylazy ATP, luferyrazy i apyrazy
Sekwencjonowanie 454
börja lära sig
wykorzystywanie równoległego pirosekwencjonowania wielu fragmentów DNA w tym samym czasie.
SMRT
börja lära sig
Wykorzystuje pojedyn.cz. polimerazy DNA w trybie ciągłym.
Marker
börja lära sig
wyznacznik, dowolna, genetycznie kontrolowana cecha fenotypowa
Marker genetyczny
börja lära sig
każdy określony fragment DNA, białko, lub fenotyp
Mapa genomu
börja lära sig
oparta na częst. rekombinacji i analizy sprzezen
Markery molekularne(dna)
börja lära sig
mapowanie cech sekwencji nie będących sekwencjami genów
Markery genetyczne i molekularne nalezy odróżnic od =/=
börja lära sig
wzorcow masowych DNA podczas elektroforezy i od chromosomow markerowych
Jak nie mozna nazwac chromosomow markerowych?
börja lära sig
Markery, nie wolno!!!
Markery molekularne związane z niekodującym DNA dzieli się na
börja lära sig
polimorfizm sekwencji 1) anonimowych, 2) mini i mikro satelitarnych
DNA fingerprinting
börja lära sig
Badanie sekwencji repetytywnych niezbędnych do celów kryminalistycznych
Fingerprinting przez amplifikację DNA - DAF polega na
börja lära sig
amplifikacji DNA z użyciem 8-10 nukleotydowych starterów i następnie rozdziale produktów reakcji PCR w denaturujacym żelu poliakrylamidowym
Każdy SSLP może mieć
börja lära sig
wiele różnych wariantów długości, co oznacza wieloallelowośćw odróżnieniu od RFLP
SSLP
börja lära sig
szeregi powtórzen sekwencji o roznej dl. zawierajacych rozna liczbe jednostek powtarzalnych
Typy SSLP
börja lära sig
VNTR i STR
VNTR jednostka powtarzalna ma
börja lära sig
kilkadziesiat nukleotydów (10-100 bp)
Technikę VNTR najczęściej stosuje się w technikach...
börja lära sig
ustalenia ojcostwa.
Allele mikrosatelitów są
börja lära sig
kodominujące i dziedziczone w sposób mendlowski.
Typowe loci mikrosatelitarne zawierają
börja lära sig
10-30 (maksymalnie 50) powtórzen motywu i osiagaja długosc 100 do 400 bp.
VNTR, jednostka powtarzalna ma
börja lära sig
klikladziesiąt nukleotydów (10-100bp)
TechnikaVNTR zostałą wyparta przez
börja lära sig
analizę polimorfizmu krótkich powtórzen tandemowych STR
STR stosuje sie przy badaniu
börja lära sig
powtórzen tandemowych (tg)n i (ca)n
Typowie loci mikrosatelitarne zawierają
börja lära sig
10-30 powtórzen motywu i długosc 100 do 400 bp
Najszybszym sposobem oznaczania polimorfizmów dł. mikrosatelitarnych jest
börja lära sig
Reakcja PCR
SSR
börja lära sig
obejmuje analize DNA mikrosatelitarnego, obecnego we wszystkich genomach różnych organzimów
SAMPL
börja lära sig
Połączenie AFLP i SSR. Amplifikowane odcinki DNA znajdujace się miedzy miejscem rozpoznawanym przez enzym res. a sekwencją mikrosatelitarną.
RFLP
börja lära sig
Marker, polimorfizm dł. fragm. restrykcyjnych, char. wariant określonego genu
RAPD
börja lära sig
marker, losowo amplifikowany polimor. DNA, char. genom
AFLP
börja lära sig
marker, polimorfizm dł. amplifikowanego fr., charakteryzuje genom
SAMPL
börja lära sig
selektywnie amplifikowany polimorfizm loci miikrosat.
SAMP wypiera
börja lära sig
klasyczny AFLP ponieważ generuje prążki o bardzo wys. polimorfizmie i umożliwia wykrycie alleli kodomnujących
SNP
börja lära sig
polimorfizm poj. nukleotydu, charakteryzuje wariant określonego genu lub polimorfizm sek. niekodującej
STS
börja lära sig
miejsce znaczone sekwencyjnie; identyfikacja chromosomow lub ich regionów
SSR
börja lära sig
amplifikowane sekwencje mikrosat, analiza genotypów
W technice PCR powiela się
börja lära sig
wybrany fragment DNA

Du måste vara inloggad för att skriva en kommentar.